Doğal Biyosentezde Yeni Bir Strateji
Görsel: Tiamin pirofosfatın kimyasal yapısı ve transketolazın protein yapısı. Tiamin pirofosfat kofaktörü (sarı) ve ksilüloz 5-fosfat substratı (siyah). Kaynak: Thomas Shafee/Vikipedi
Mikroorganizmalar, hastalığa neden olan virülans faktörlerine veya avcılarına ve rakiplerine karşı savunma kimyasalları gibi doğal ürünler sentezlemektedirler. Freiburg Üniversitesi’nin Biyoloji Fakültesi, Biyoloji Enstitüsü II’deki Dr. Robin Teufel ve baş yazar Ying Duan liderliğindeki bir ekip, Bonn Üniversitesi’ndeki araştırmacılar ile birlikte, bakteriyel tropon ürünlerinin üretimi için çok önemli olduğu düşünülen yeni bir enzim keşfetmişlerdir. Sonuçlar American Chemical Society dergisinde yayımlanmıştır.
Kara ve su ortamlarında bulunan bakteriler, bitkiler, algler veya daha az gelişmiş diğer canlılar ile simbiyotik olarak etkileşime girdiklerinde, örneğin mercanlarda ve süngerlerde bulunan mikrobiyal patojenlere karşı koruyucu maddeler olarak tropon isimli doğal ürünler üretmektedirler. Freiburg araştırmacıları ise simbiyotik yaşayan bu bakterilerin ilgili biyoaktif maddeleri nasıl ürettiklerini araştırmışlardır. Böylece Teufel ve ekibi, bu bakteriyel troponların üretimi için gerekli olan enzim türünü keşfetmişlerdir.
Tropon biyosentezinde anahtar ara ürün
Ekip, bu enzimin oksijeni daha önce gözlemlenmemiş bir biçimde aktifleştirdiğini ve kimyasal bir prekürsor bileşik ile etkileştirdiğini bulmuşlardır. Bu süreçte, troponun temel yapısı oluşturulmaktadır. Araştırmacılar, kimyasal ve biyokimyasal yöntemler kullanarak, ilgili enzimin işlevlerini daha ayrıntılı olarak araştırabilmiş ve tropon biyosentezindeki ara ürünleri tanımlayabilmişlerdir. Teufel, “Bu önemli bileşiklerin biyosentezini daha iyi anlamak adına büyük bir adım atmayı başardık. Elde ettiğimiz bulgular, gelecekte spesifik patojenler ile daha iyi mücadele etmek veya biyoteknolojik yöntemler kullanarak yeni tropon bileşikleri elde etmek için bir temel oluşturabilir,” demiştir.
Makaleyi görüntülemek için “Bir Flavoprotein Dioksijenaz, Koenzim A-Ester Oksijenoliz ve Halka Epoksidasyonu Aracılığı ile Bakteriyel Tropon Biyosentezini Yönlendirmektedir” buraya tıklayın.
Kaynak: phys.org
